Le origini della chiesa rimangono sconosciute, ma le prime notizie storiche risalgono al 1644. Dopo anni di totale abbandono, la struttura rinacque nel 1875 grazie all'interessamento e alla devozione della famiglia Miscione: l'edificio fu inaugurato e benedetto con una solenne funzione sacra, alla quale parteciparono le autorità cittadine e migliaia di persone. Al termine di quella prima celebrazione, la statua del Santo venne portata in processione in mare sopra le paranze, le tipiche barche da pesca locali. A completare l'opera, quattro anni dopo, fu realizzata su disegno di Alfonso Celano una piccola stanza annessa alla cappella, pensata come alloggio per il sacerdote affinché potesse recarsi sul posto anche nei mesi invernali.
Nonostante la riapertura, per circa trent’anni la caratteristica processione in mare non venne più ripetuta. Fu nel 1903 che si volle finalmente rinnovare quella tradizione: la statua del Santo, imbarcata nel piccolo porticciolo della Meta, navigò seguita da molte altre imbarcazioni fino a raggiungere la stazione di Vasto Marina, accolta da una folla immensa sull'arenile. Una volta a riva, la statua fu consegnata ai marinai di tutte le paranzelle, che a turno la portarono in spalla. Altri importanti interventi sulla struttura vennero effettuati nell’estate del 1959 a spese del Genio Civile di Chieti, con il rifacimento totale del tetto, il prolungamento dell’abitazione di oltre due metri e lo
spostamento del campanile nella posizione in cui lo si vede oggi.

La facciata è molto semplice, sul portale d'ingresso, una finestra rettangolare e un piccolo occhio rotondo nel timpano, con due finestrelle quadrate ai lati della porta.
Lo spazio interno è piccolo e custodisce la storica statua di San Nicola venerata dai marinai e dalla comunità. 

La struttura è completamente priva di barriere architettoniche, risultando accessibile a tutti. 

La chiesa non ha un programma quotidiano o settimanale fisso di Sante Messe ordinarie. Le celebrazioni avvengono principalmente in occasione della Festa di San Nicola della Meta (che si tiene ogni anno a giugno).